Son nom signifie « le nouveau volcan » et il fut le siège, en 1600, de la plus puissante éruption sud-américaine des temps historiques (IEV=6), expulsant, le long d’une fissure, environ 30 Km3 de matériaux pyroclastiques. Le Huyanaputina est un édifice à la morphologie assez discrète. Il s’agit d’un volcan construit sur les « ruines » d’un édifice beaucoup plus ancien, d’âge Tertiaire à pléistocène, largement attaqué par une puissante avalanche de débris et par l’érosion glaciaire. L’éruption de 1600, qui reste la seule éruption historique répertoriée, a émis des coulées pyroclastiques qui se sont propagées jusqu’à 13 Km de distance, et les dépôts cendreux ont été repris en très volumineux lahars qui ont atteint l’océan pacifique, à 120 Km de distance. De très grands dégâts ont été causés aux villes d’Arequipa et Moquengua et il fallut près d’un siècle et demi à l’économie régionale pour se remettre de la catastrophe.